Kajaanin Vesi -liikelaitoksen toimintaa johtaa johtokunta. Kajaanin Vesi – liikelaitoksen tehtävänä on huolehtia toiminta-alueellaan vesihuoltolain mukaisesta vesihuollosta taloudellisesti ja kilpailukykyisesti yhdyskuntakehityksen tarpeita vastaavasti.
Johtokunnan puheenjohtajana toimii Janne Heikkinen ja varapuheenjohtajana Pasi Arffman. Esittelijänä toimii liikelaitoksen johtaja ja sihteerinä verkostopäällikkö tai käyttöpäällikkö.